根据上海市水环境功能区划和相应的水质控制标准，黄浦江淀峰和松浦大桥2个断面水质控制标准为II类水，临江断面水质控制标准为III类水，南市水厂、杨浦大桥和吴淞口3个断面水质控制标准为IV类水。
与2009年相比，2010年黄浦江临江和南市水厂断面水质综合污染指数（计算方法详见附录）分别上升1.1%和2.0%，淀峰、松浦大桥、杨浦大桥和吴淞口断面水质综合污染指数分别下降13.5%、4.2%、1.9%和2.1%。黄浦江总体水质状况有所好转。
近5年（2006～2010年）的监测数据表明，2006～2008年黄浦江总体水质状况基本保持稳定，2009年起黄浦江总体水质状况有所好转。
作为上海市主要出境控制断面的黄浦江杨浦大桥断面化学需氧量浓度从2005年的18.32毫克/升下降至2010年的13.91毫克/升，降幅达24.1%。
