全市生态环境质量持续改善。水环境质量总体上与2005年基本持平，黄浦江水质保持稳定，苏州河上下游水质已无明显差异；全市环境空气质量优良率达到88.8%，二氧化硫、二氧化氮、可吸入颗粒物年日平均浓度分别下降10%、16%和2%；声环境质量有所改

善，本市的区域环境噪声和主要道路交通噪声平均等效声级较2005年均有下降；辐射环境未见异常变化，本市环境介质中的各种放射性核素浓度处于正常水平，电磁辐射环境背景无明显变化，主要电磁辐射设备周围环境的工频电场强度、工频磁感应强度和综合电场强度均符合《500千伏超高压送变电工程电磁辐射环境影响评价技术规范》（HJ/T24-1998） 的参考限值规定和《电磁辐射防护规定》（GB8702-88）中的相关规定。
    2006年，全市新建公共绿地808公顷，绿化覆盖率达到37.3%， 人均公共绿地面积比2005年增加了0.5平方米。崇明新辟3.4万亩生态林,郊区建成生态公益林1.3万亩。外环生态林建成160公顷。